Temporada
Episodio
- Episodio 1: Bajo estas calles
- Episodio 2: Tortugas a Juicio
- Episodio 3: Irma se convierte en gigante
- Episodio 4: El hámster maltés
- Episodio 5: Tortugas en el cielo
- Episodio 6: Cambio de mentes
- Episodio 7: El día de Burne
- Episodio 8: La quinta tortuga
- Episodio 9: El rey de las ratas
- Episodio 10: Tortugas en el núcleo de la Tierra
- Episodio 11: La locura a Abril
- Episodio 12: El ataque del gran MACC
- Episodio 13: La espada de ninguna parte
- Episodio 14: 20.000 goteras bajo la ciudad
- Episodio 15: Llevadme hasta vuestro líder
- Episodio 16: Las cuatro Mosquetortugas
- Episodio 17: Tortugas, tortugas por todas partes
- Episodio 18: Cowabunga contra el Despedazador
- Episodio 19: Invasión extraterrestre
- Episodio 20: Cámara con vida propia
- Episodio 21: Celos verdes
- Episodio 22: El Regreso de la Mosca
- Episodio 23: Casey Jones - Un héroe fuera de la ley
- Episodio 24: El monstruo del mutageno
- Episodio 25: Invasión de la corporación de la Dimensión X
- Episodio 26: Pizza contra el Despedazador
- Episodio 27: Super Bebop y Poderoso Rocksteady
- Episodio 28: Cuidado con el loto
- Episodio 29: Mirando al pasado
- Episodio 30: Cabeza de Cuero: El terror de los pantanos
- Episodio 31: El cumpleaños de Michelangelo
- Episodio 32: Usagi Yojimbo
- Episodio 33: El caso del kimono robado
- Episodio 34: Usagi ven a casa
- Episodio 35: La creación de Cabeza de Metal
- Episodio 36: Cabeza de Cuero se encuentra con el Rey de las Rata
- Episodio 37: El exterminador de tortugas
- Episodio 38: El gran Boldini
- Episodio 39: El mapa desaparecido
- Episodio 40: La pandilla esta aquí
- Episodio 41: El Grybyx
- Episodio 42: El Señor Ogg llega a la ciudad
- Episodio 43: Despedazadorlandia
- Episodio 44: Adiós, mosca
- Episodio 45: El gran robo
- Episodio 46: La gran aparición
- Episodio 47: El gran reventón
Las Tortugas Ninja Temporada 3 Usagi Yojimbo
Son grandes, son verdes, son auténticas máquinas de combate y les encanta la pizza.... ¡Son las Tortugas Ninja! Michelangelo, Leonardo, Raphael y Donatello son los nombres de estas jóvenes tortugas mutantes entrenadas por el maestro Astilla, un maestro ninja mutado a rata que les enseñó todo tipo de técnicas de combate desde que eran pequeños. Juntos luchan contra el mal y contra su archienemigo, el malvado Despedazador.
